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1 人阅读发布时间:2026-07-10 15:42
在细胞实验中,经常出现细胞状态变差、实验结果难以重复、不同批次间数据差异明显等问题。这些问题的根源有时不在于操作本身,而在于细胞交叉污染或身份误认。STR鉴定是目前细胞身份验证最常用、最可靠的方法之一。但STR数据的比对分析往往耗时费力、容易出错。
为帮助科研人轻松完成STR数据比对,普诺赛®推出了在线STR数据比对工具,该工具支持人源/小鼠源细胞STR位点数据手动输入或Excel批量上传,自动匹配Cellosaurus数据库,一键导出结果,让细胞身份验证更快更准。
本期细胞学堂将详细介绍普诺赛®STR数据比对工具使用方法,同时带您快速了解STR鉴定技术原理,助您高效完成细胞身份验证。
一、STR鉴定原理
STR(Short Tandem Repeats,短串联重复序列)又称微卫星DNA(Microsatellite DNA),是基因组中的一类重复DNA序列,通常由2-6个碱基组成的核心序列串联重复排列,因核心序列重复次数的不同而产生长度多态性。这种高度的遗传多态性使其成为个体识别、亲缘关系鉴定及细胞身份鉴定的理想分子标记。
STR鉴定技术以聚合酶链式反应(PCR)为核心,首先通过特异性引物对样本中多个核心STR位点进行选择性扩增,扩增产物随后通过毛细管电泳技术进行分离,利用凝胶的分子筛效应按长度差异实现不同STR片段的区分。然后借助专业分析软件(如Applied Biosystems公司的GeneMapper)对电泳数据进行解读,输出包含样本基因型信息的STR峰图(图1)。
图1.STR鉴定峰图
从STR峰图中提取每个STR位点的等位基因信息后,必须将数据与权威细胞数据库(如Cellosaurus、ATCC)进行比对分析,才能确认细胞身份。人工比对不仅耗时耗力,还容易因主观判断失误出现误差,借助经验证的STR数据分析工具进行自动化分析,可大幅提高比对效率与准确性。
二、普诺赛®STR数据比对工具
为解决科研人员的实际需求,普诺赛®开发了STR数据比对工具,同时,普诺赛®建立了细胞系身份验证体系:所售出的细胞系均附带STR鉴定报告,同时还可提供人源STR鉴定、小鼠STR鉴定、种属鉴定三大鉴定服务,形成从细胞获取到身份验证的完整质量控制闭环。
01、工具概述
1. 访问普诺赛®官网,进入“技术资源-细胞信息查询”页面后,即可开始使用STR数据比对工具。
2.工具支持人(Human)、小鼠(Mouse)两种细胞系的STR信息比对,系统中有两种数据提交方式:
①手动输入STR数据:适用于单个样本的快速分析。
②Excel批量上传STR数据:适用于多个样本高效处理。
3.系统在接收数据后,将自动与Cellosaurus数据库进行比对分析,并通过以下形式展示数据结果:
①按匹配度从高到低排列最相似细胞系。
②匹配到的细胞系可点击跳转至Cellosaurus数据库,查看完整条目信息,包括细胞来源、培养历史等。
③支持一键导出 Excel 结果,方便实验记录与数据追溯。
02、案例演示
案例一: 手动输入STR数据比对
以JIMT-1(人乳腺癌细胞)为例,具体操作步骤如下:
A. 登录普诺赛®官网→技术资源-细胞信息查询→STR数据比对工具
B. 选择“Human” 模式,将STR报告中Marker的等位基因数据填入对应字段(如:CSFIPO 12,13)。
C. 输入完成后,点击“查询”,系统将自动完成匹配。
D. 结果显示:样本与JIMT-1细胞系STR匹配度为100%,细胞身份确认。
E. 点击细胞名称前的Accession(如JIMT-1对应的CVCL_2077),可跳转至 Cellosaurus 数据库查看详情。
F. 点击“Export table” ,即可导出Excel结果文件。
案例二: Excel批量上传STR数据比对
以JIMT-1(人乳腺癌细胞)和MRC-5 (人胚肺细胞) 为例,具体操作步骤如下:
A. 登录普诺赛®官网→技术资源-细胞信息查询→STR数据比对工具
B. 点击“文件下载模板”,下载人源STR数据模板。
C. 在Excel模板中,按照表头提示填写待测细胞Marker的等位基因数据。
D. 返回工具页面,点击 “读取文件” ,上传已填写好的Excel表格,再点击 “Batch Query” 启动批量分析。
E. 分析完成后,系统会自动生成包含多个工作表(Sheet)的Excel结果文件。每个样本对应独立 Sheet,结果清晰、便于逐一核对。
F. 点击细胞对应的 Accession 编号(如 MRC-5 对应 CVCL_0440)即可跳转至 Cellosaurus 数据库页面,进一步查看该细胞系的背景信息与相关注释。
以上就是本次细胞STR鉴定技术原理及普诺赛®STR数据比对工具使用方法。使用普诺赛®STR数据比对工具,帮助你轻松完成细胞身份验证。
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